Giriş: Matris destekli lazer desorpsiyon iyonizasyon uçuş süresi kütle spektrometrisi (MALDI-TOF MS), son on yılda mikroorganizmaların tanımlanması için hızlı ve güvenilir bir yöntem olarak sık kullanılmaktadır. Bu yöntemde sadece bir gram-negatif seçici besiyerinin önerilmiş olması tanıda sorunlara neden olmaktadır. Çalışmada kullanılan Slanetz and Bartley (SB) agarın, bakterilerini tanımlama açısından MALDI-TOF MS’de kullanılabileceğine dair bilimsel literatürlerde herhangi bir bilgi yoktur. Materyal ve Metod: Bu çalışmada, Van ve çevresindeki içme-kullanma ile göl sularından izole edilen enterokokların MALDI-TOF MS yöntemi ile SB agar besiyerinde üreyen enterokok bakterileri tanımlama performansının kanlı agar ile birlikte karşılaştırılarak yapılması ve bu performansı arttırıcı basit ve hızlı bir örnek hazırlama yönteminin geliştirilmesi amaçlanmıştır. Bu amaçla altı ay süresince 60 şebeke ve 30 göl suyu numunesi incelemeye alınmıştır. Bulgular: Numuneler membran filtrasyon yöntemi ile çalışılmıştır. İzole edilen enterokoklar, MALDI-TOF MS yöntemi ile hem kanlı agardan hem de selektif besiyeri olan SB besiyerinden direk olarak alınan izolatlar ile karşılaştırmalı tanımlama yapılmıştır. Her iki besiyerinde yapılan tür tayininde aynı sonuçlar elde edilmiştir. Bu sonuçlara göre şebeke suyu izolatların %35’i Enterococcus casseliflavus, %30’u Enterococcus faecalis, %26.7’si Enterococcus faecium, %6.6’sı Enterococcus hirae, %1.7’si Enterococcus columbae olarak, göl suyu izolatların ise %20’si E. casseliflavus, %40’ı E. faecalis, %36.7’si E. faecium, %3.3’ü E. hirae olarak tanımlanmıştır. Şebeke suyunda E. casseliflavus, göl suyunda E. faecalis en sık izole edilen enterokok türleridir. Sonuç: Kütle spektrometrik tanımlamaya uygunluğu hakkında bugüne kadar herhangi bir veri bulunmayan SB agar gibi selektif besiyerinden de alınabileceğinin saptanması, MALDI-TOF MS’nin mikrobiyoloji laboratuvarlarında daha etkin ve hızlı kullanımına katkı sağlayacaktır. Ayrıca incelenen tüm suların önemli sayılabilecek düzeyde mikrobiyal kontaminasyona maruz kaldığı ve halk sağlığı açısından potansiyel bir tehlike arz ettiği kanaatine varılmıştır. Bu suların tüketiminin immün sistemi baskılanmış, hasta ve yaşlılar ile çocuklarda potansiyel sağlık riski oluşturabileceği ortaya koyulmuştur.
Introduction: Matrix assisted laser desorption ionization time-of-flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS) has been used frequently in the last decade as a fast and reliable method for the identification of microorganisms. The fact that only one gram-negative selective medium is recommended in this method causes problems in the diagnosis. There is no information in the scientific literature that Slanetz and Bartley (SB) agar used in the study can be used in MALDI-TOF MS to identify bacteria. Materials and Methods: In this study, it was aimed to compare the identification performance of enterococci isolated from drinking-use and lake waters in Van and its surroundings with blood agar by using MALDI-TOF MS method and to develop a simple and fast sample preparation method that increases this performance. For this purpose, 60 mains and 30 lake water samples were examined for six months. Results: The samples were studied by the membrane filtration method. The isolated enterococci were identified by MALDI-TOF MS method with the isolates taken directly from both blood agar and SB medium, which is a selective medium. The same results were obtained in the species determination in both media. According to these results, 35% of the mains water isolates were Enterococcus casseliflavus, 30% Enterococcus faecalis, 26.7% Enterococcus faecium, 6.6% Enterococcus hirae, 1.7% Enterococcus columbae, and 20% of lake water isolates E. casseliflavus, 40% E. faecalis, 36.7% E. faecium, 3.3% E. hirae, E. casseliflavus in mains water and E. faecalis in lake water are the most frequently isolated enterococci species. Conclusion: Determining that it can also be obtained from selective media such as SB agar, for which there is no data on its suitability for mass spectrometric identification, will contribute to the more effective and rapid use of MALDI-TOF MS in microbiology laboratories. In addition, it has been concluded that all the waters examined are exposed to a significant level of microbial contamination and pose a potential danger to public health. It has been revealed that the consumption of these waters may pose a potential health risk for immunocompromised patients and the elderly, as well as children.
