Alzheimer Hastalığı İçin Çoklu Hedefe Yönelik Benzimidazol-2- Selenon Türevlerinin Tasarımı, Enzimatik Ve Hücresel Düzeyde Biyolojik Değerlendirilmesi
Demirci H., Taslimi P.(Yürütücü), Şentürk H., Sadeghian N., Aktaş A., Özbek F. E.
TÜBİTAK Projesi, 1002 - Hızlı Destek Programı, 2026 - 2027
- Proje Türü: TÜBİTAK Projesi
- Destek Programı: 1002 - Hızlı Destek Programı
- Başlama Tarihi: Eylül 2026
- Bitiş Tarihi: Eylül 2027
Proje Özeti
Bu projenin temel amacı;
nitrobenzil-sübstitüentli benzimidazol-2-selenon yapısına sahip toplam 10 özgün
türevin rasyonel ilaç tasarım prensipleri doğrultusunda sentezlenmesi,
ayrıntılı yapısal karakterizasyonlarının yapılması ve Alzheimer hastalığının patogenezinde
kritik rol oynayan AChE, BChE, MAO-A, MAO-B ve BACE-1 enzimleri üzerindeki
inhibitör potansiyellerinin sistematik olarak ortaya konulmasıdır. Seçilen
benzimidazol çekirdeği, heterosiklik aromatik yapısı sayesinde hem katalitik
aktif bölgeye hem de periferik anyonik bölgeye bağlanabilme kapasitesi
gösteren, literatürde çoklu biyolojik hedeflerle etkileşime girdiği kanıtlanmış
ayrıcalıklı (privileged) bir farmakofordur. Nitrobenzil grubunun moleküle
kazandırdığı elektronik çekicilik ve lipofilik karakter, enzim aktif
bölgelerinde π–π ve hidrofobik etkileşimleri güçlendirme potansiyeli taşırken,
selenon fonksiyonel grubunun redoks-aktif yapısı oksidatif stresin
baskılanmasına katkı sağlayabilecek nöroprotektif bir avantaj sunmaktadır.
Böylece seçilen yapı iskeleti, yalnızca enzim inhibisyonuna değil aynı zamanda
Alzheimer patogenezinin önemli bileşenlerinden biri olan oksidatif stres
modülasyonuna da katkı sağlayabilecek şekilde tasarlanmıştır.
Proje, Alzheimer hastalığının tek bir biyolojik
hedef üzerinden kontrol edilemeyen çok faktörlü doğasını dikkate alan çoklu
hedefe yönelik ilaç tasarımı (multi-target-directed ligand, MTDL) yaklaşımını
benimsemektedir. Bu bağlamda kolinerjik sistem bozukluğunu (AChE, BChE),
monoaminerjik nörotransmitter metabolizmasını (MAO-A, MAO-B) ve amiloid-β
oluşumunu (BACE-1) eş zamanlı olarak modüle edebilecek moleküllerin
geliştirilmesi hedeflenmektedir. Sentezlenecek 10 türevin yapıları ¹H-NMR,
¹³C-NMR, HRMS ve IR analizleri ile doğrulanacak; ardından söz konusu beş enzime
karşı inhibitör aktiviteleri in vitro olarak belirlenerek IC50 değerleri hesaplanacaktır. IC50 ≤ 10 µM aktivite gösteren adaylar için
ayrıntılı enzim kinetiği çalışmaları gerçekleştirilerek Ki değerleri ve
inhibisyon mekanizmaları (kompetitif, nonkompetitif veya miks tip) ortaya
konulacaktır. En az üç hedef enzim üzerinde anlamlı inhibisyon sergileyen ve
düşük Ki değerlerine sahip en güçlü üç aday molekül, SH-SY5Y nöronal hücre
hattında sitotoksisite ve oksidatif stres parametreleri açısından
değerlendirilecek; hücresel güvenliliği doğrulanan en güçlü aday ise ICV-STZ
ile oluşturulmuş deneysel Alzheimer modelinde in vivo olarak test
edilecektir. Beyin dokusunda AChE, BChE, MAO-A, MAO-B ve BACE-1 enzim
aktiviteleri ölçülecek; MDA ve GSH düzeyleri ile nöroenflamatuvar parametreler
analiz edilecek ve Morris su labirenti testi ile bilişsel performans
değerlendirilecektir. Elde edilen biyokimyasal ve davranışsal veriler
arasındaki korelasyon analiz edilerek çoklu enzim inhibisyonunun fonksiyonel
sonuçlara yansıması ortaya konacaktır. Deneysel olarak umut verici bulunan
adaylar için moleküler docking çalışmaları ile bağlanma enerjileri ve aktif
bölge etkileşimleri incelenecek; sonuçlar deneysel IC₅₀ ve Ki değerleri ile ilişkilendirilerek
yapı-aktivite ilişkisi açıklanacaktır. Ayrıca DFT hesaplamaları ile elektronik
parametreler belirlenerek inhibitör güç ile bağlantıları analiz edilecek ve in
silico ADMET değerlendirmeleri ile kan-beyin bariyeri geçiş potansiyeli ve
ilaç benzerliği özellikleri öngörülecektir.